Capítulo de livro · Informação, Dados e Tecnologia

Aspectos do ciclo de vida de dados em processos de construção de ontologias biomédicas

Autoria

  • Jeanne Louize Emygdio Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
  • Eduardo Ribeiro Felipe Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)

Resumo

Tendo por foco o estudo das coisas existentes no mundo e das relações que estas estabelecem entre si, as Ontologias vêm ganhando campo especial de investigação científica por serem consideradas alternativas viáveis à organização das informações massivas e ininterruptamente alimentadas pelos seres humanos nos espaços digitais, por meio das tecnologias da informação e comunicação (TICs). As perspectivas centrais da utilização das ontologias repousam sobre as possibilidades de prover interoperabilidade semântica entre os sistemas de informação, pouco alcançada por meio dos modelos, técnicas e ferramentais usualmente aplicados. O objetivo deste artigo é descrever de que forma a gestão do ciclo de vida dos dados pode contribuir para prover maior qualidade à construção de ontologias biomédicas. A metodologia adotada foi a pesquisa qualitativa, de caráter descritivo sobre os processos de construção da Ontologia realista Obstétrica e Neonatal - OntoNEO. Os resultados encontrados comprovaram a eficiência do plano de gestão de dados como requisito de atribuição de qualidade à referida ontologia, o que a habilitou a integrar o projeto Basic Formal Ontology - BFO, padrão de referência na construção de ontologias realistas de alto nível.

Palavras-chave

Ontologias biomédicasCiclo de vida de dadosPlano de gestão de dadosRepresentação do conhecimento

Dados da publicação

Publicado em
Informação, Dados e Tecnologia (Livro)
Organização
Guilherme Ataíde Dias; Moisés Lima Dutra; Fábio Mosso Moreira; Fernando de Assis Rodrigues; Ricardo César Gonçalves Sant'Ana
ISBN
978-85-67703-05-3
Idioma
Português
Páginas
527–544
Ano
2018
Origem
II WIDaT — WIDaT – Workshop de Informação, Dados e Tecnologia

Apresentação em vídeo

xOlá a todos meu nome é Eduardo sou aluno de doutorado na Universidade Federal de Minas Gerais sob a orientação do professor doutor Maurício Barcelo de Almeida eu e minha colega Jeane gostaríamos de apresentar o nosso artigo intitulado Aspectos do ciclo de vida de dados em processo de construção de ontologias biomédicas no segundo o workshop de informação dados e tecnologia dos nossos colegas da Universidade Federal da Paraíba.<br />Estaria apresentando a primeira parte com a introdução, referencial teórico, objetivos e logo em seguida minha colega dará seqüência a essa apresentação. Nessa primeira etapa eu dividi em quatro grandes grupos, onde o artigo na introdução apresenta conceitos ontologias em suas origens na filosofia, a sua vocação na representação na realidade dos seres, os seus aspectos intimamente ligados às classificações e principalmente a sua capacidade de estabelecer relações entre os elementos.<br />Também o artigo retrata interdisciplinaridade como um ponto forte das das ontologias e contribuições na área médica na questão da web semântica não podemos deixar de citar a capacidade da ontologia de retratar a realidade em um ambiente virtual na questão dos dados, também colocamos a origem das primeiras representações de conceitos de dados na teologia, o dado enquanto reflexo do contexto, o dado dependente da interpretação do observador e também a sua questão como insumo dos sistemas de informação. Insumo é uma unidade básica dos instrumentos informacionais utilizamos a definição da OECD com uma definição norteadora dos conceitos estabelecidos no artigo e com relação ao ciclo de vida citamos nesses slides aqui quatro boas referências que nos ajudaram na construção do trabalho falando mais especificamente sobre ciclo de vida a identificação inicial foi que ciclo de vida muitas vezes é citado em desenvolvimento de software em construção de ontologias mas foi um pouco mais difícil encontrar essa definição relacionada aos dados é importante ressaltar que encontramos definições de ciclo de vida em dados, porém é direcionados unicamente à persistência dos dados em um período onde a preocupação era o armazenamento e recuperação das informações visto que muitas informações foram perdidas quando os suportes informacionais tecnológicos, as fitas magnéticas nos disquetes eram substituídos com uma velocidade muito rápida impossibilitam muitas vezes a recuperação dos dados, a autora Briney ela apresenta dois ciclos de vida interessantes, um ciclo de vida que ela denomina de antigo com quatro processos básicos como é visto no slide e um ciclo de vida que ela denomina novo onde ela acrescenta os processos de preservação e reuso.<br />Também é importante notar nos dois outros ciclos de vidas importantes no artigo o da DataONE e de Santana especificamente direcionam ciclo de vida para a ciência da informação e nos remete muitas vezes e nos lembra muitas vezes no modelo interativo de desenvolvimento de software, pois bem em relação aos objetivos nós procuramos combinar os interesses de nossas teses do grupo de pesquisa Recol e da disciplina do professor Guilherme Dias, encontramos no trabalho da professora Fernanda Farinelli a ontologia OntoNEO e procuramos então compreender o ciclo de vida dos dados biomédicos em processo de construção ontológica. <br />Pelo tempo já procurando concluir a primeira parte eu quero destacar então que o ciclo de vida de dados ele traz diversos benefícios, ele pode tratar facilidade na recuperação dos dados da informação, ele pode permitir o uso em análise dos dados na pesquisa pelo próprio pesquisador como colaboradores ele é o ciclo de vida de dados, ele pode melhorar a tomada de decisão e principalmente fornecer dados de qualidade para pesquisas translacionais, onde um instrumento é utilizado como origem como fonte para outros instrumentos, pode permitir que cientistas externos ao projeto encontrem, entendam e utilizem esses dados no futuro e dentro desse cenário acrescentando a documentação por metadados é possível então estabelecer situações e créditos futuros de uma maneira mais ampliada além de permitir a rastreabilidade autoral. <br />Eu passo então para a segunda parte da apresentação do artigo agradeço a atenção de todos muito obrigado. <br />Saudações a todos meu nome Jeanne eu sou aluna de doutorado do programa de pós graduação em Gestão e Organização do Conhecimento da Universidade Federal de Minas Gerais e orientanda do Professor Doutor Luis Barcelos já aumenta nessa segunda parte vou apresentar a vocês os procedimentos metodológicos os resultados e as considerações finais do nosso estudo.<br />O estudo se caracterizou por uma natureza qualitativa caráter descritivo tendo sido realizado em três fases: a primeira delas compreendeu uma análise dos procedimentos de construção do OntoNEO em comparação com os processos de governança de dados previamente estudados representados pelo colega Eduardo utilizei aqui os termos processo de governança para compreender as fases do ciclo de vida de dados e processos dos planos de gestão de dados com vistas ao simplificar a minha apresentação.<br />A fase 2 nós organizamos os procedimentos de construção da OntoNEO em processos de governança de dados selecionados de Briney (2005), DataONE (2018) e Dias (2018). Esse último trabalho se baseia em padrões da Universidade Virginia para governança de dados.<br />Na fase 3 fizemos uma análise dos aspectos de qualidade e agregados ao OntoNEO em função das práticas de governança que foram adotadas em sua construção, encontramos dois resultados principais ao término do nosso estudo. O primeiro deles repousa sobre uma percepção clara dos aspectos de qualidade que a governança de dados pode proporcionar aos processos de construção de ontologias biomédicas e o segundo reforço de identificação de cinco macro processos relacionados à governança de dados e que podem ser aplicáveis a construção de ontologias biomédicas.<br />Então detalhando um pouquinho desses dois resultados nós temos entre os aspectos de qualidade identificados o primeiro deles repousando sobre uma premissa de que a ontologia na ser construída ela seria integrante de uma iniciativa denominada OBO Foundy é uma iniciativa internacional de construção de ontologias de alto valor de qualidade para integração de dados biomédicos.<br />Então pra que uma ontologia se agregue a esta iniciativa ela precisa também ser construída com altos padrões de qualidade seguindo as premissas definidas por esse projeto.<br />Então para o alcance desse nível de qualidade nós percebemos que a professora Fernanda ela adotou padrões tecnológicos internacionais especificidades técnicas e administrativas do contexto real médico que eles vão depressivo reuso de dados de outras antologias já integrantes a iniciativa OBO Foundy. Portanto com qualidade já previamente certificada pela iniciativa ou redução de modelos de ciclo de vida para a construção de sistemas de informação da área de engenharia de software da ciência da computação para a condução das práticas de engenharia de antologias no campo da ciência da informação o que também contribuiu para o aumento da qualidade dos artefatos final gerando.<br />Foi realizada uma prova de conceito que garantiu a eficiência do artefato informacional gerado no atendimento aos propósitos que motivaram sua construção. Esse modelo portanto ele é um modelo de representação do conhecimento de alta qualidade para a representação de dados biomédicos e foi disponibilizado em formato aberto em caráter permanente tendo um site próprio e ainda sendo possível o seu acesso no repositório de acesso público bio portal que também integra a iniciativa OBO Foundy paralelamente percebemo uma ampla divulgação e compartilhamento do conhecimento científico produzido pela pesquisadora.<br />A pesquisa também recebeu financiamentos de agências de fomento nacionais e internacionais porque ela foi realizada com uma pesquisa do tipo sanduíche, ela se realizou em parte do departamento de filosofia informática biomédica da Universidade de Buffalo e em parte aqui na escola sem essa informação da Universidade Federal de Minas Gerais.<br />Na sequência nós passamos ao detalhamento dos cinco macro processos que foram percebidos e que compreendem a gestão de informações sobre dados e formatos a gestão de conteúdo dos metadados e formatos a gestão de políticas para acesso, compartilhamento erros de dados a gestão de armazenamento de longo prazo e gestão de questões orçamentárias, então esses 5 macroprocessos, eles nos permitiram é uma visão de aderência ao ciclo de vida estudados em cada um daqueles autores que já foram citados nos dando uma percepção de que ainda não tenha sido esse o propósito inicial da pesquisa realizada pela nossa colega o cuidado a meticulosidade dela durante todas as fases de construção da ontologia ela permitiu uma aderência clara a ciclos de vida relevantes para a governança de dados e uma visualização de macroprocesso candidatos a estruturação de planos de gestão de dados específicos para esse tipo de pesquisa sendo assim nas nossas considerações finais temos retornar aos objetivos do nosso estudo afirmarmos que em função do volume e do valor dos resultados oriundos da pesquisa realizada pela professora doutora Fernanda Farinelli e que foi analisado em nosso estudo concluímos que a adoção de práticas de governança de dados em processos de construção de ontologias elas agregam maior qualidade aos artefatos informacionais gerados possibilita a formalização de melhores práticas para os processos de engenharia de ontologias e podem ainda fomentar pesquisas para formalização de ciclo de vida de dados ou planos de gestão de dados aplicáveis aos processos de engenharia de ontologias promovendo também avanços nas pesquisas voltadas à governança de dados.<br />Deixamos aqui os nossos contatos para elucidação de possíveis dúvidas e agradecemos a atenção de todos e pela grata oportunidade participarmos do 2º WIDAT um forte abraço.<br />